Writing Skills
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deploy-shinyproxy【部署与运维】複数のコンテナ化されたShinyアプリケーションをホスティングするためにShinyProxyを デプロイする。ShinyProxyのDockerデプロイメント、application.yml設定、Shinyアプリの Dockerイメージ、認証、コンテナバックエンド、利用追跡、スケーリングをカバーする。 単一エントリーポイントで複数のShinyアプリをホスティングする時、アプリごとの認証と アクセス制御が必要な時、隔離されたDockerコンテナとしてShinyアプリをデプロイする時、 利用分析と監査ログを備えた単一アプリデプロイメントを超えるスケーリング時に使用する。
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認証と利用追跡を備えた複数のコンテナ化Shinyアプリケーションをホスティングするため、ShinyProxyをデプロイする。
各Shinyアプリには独自のDockerイメージが必要。Shinyアプリ用のDockerfile例:
FROM rocker/shiny:4.5.0
RUN apt-get update && apt-get install -y \
libcurl4-openssl-dev \
libssl-dev \
&& rm -rf /var/lib/apt/lists/*
RUN R -e "install.packages(c('shiny', 'bslib', 'DT', 'dplyr'), \
repos='https://cloud.r-project.org/')"
COPY app/ /srv/shiny-server/app/
RUN chown -R shiny:shiny /srv/shiny-server/app
USER shiny
EXPOSE 3838
CMD ["R", "-e", "shiny::runApp('/srv/shiny-server/app', host='0.0.0.0', port=3838)"]
各アプリのビルドとテスト:
docker build -t myorg/dashboard:latest ./apps/dashboard/
docker run --rm -p 3838:3838 myorg/dashboard:latest
期待結果: 各Shinyアプリが独自のコンテナで独立して実行される。
application.yml:
proxy:
title: "Shiny Applications"
port: 8080
container-backend: docker
docker:
internal-networking: true
authentication: simple
admin-groups: admins
users:
- name: admin
password: admin_password
groups: admins
- name: analyst
password: analyst_password
groups: users
specs:
- id: dashboard
display-name: "Analytics Dashboard"
description: "Interactive data analysis dashboard"
container-image: myorg/dashboard:latest
container-cmd: ["R", "-e", "shiny::runApp('/srv/shiny-server/app', host='0.0.0.0', port=3838)"]
container-network: shinyproxy-net
port: 3838
access-groups: [admins, users]
- id: report-builder
display-name: "Report Builder"
description: "Generate custom reports"
container-image: myorg/report-builder:latest
container-cmd: ["R", "-e", "shiny::runApp('/srv/shiny-server/app', host='0.0.0.0', port=3838)"]
container-network: shinyproxy-net
port: 3838
access-groups: [admins]
logging:
file:
name: /opt/shinyproxy/log/shinyproxy.log
server:
forward-headers-strategy: native
docker-compose.yml:
services:
shinyproxy:
image: openanalytics/shinyproxy:3.1.1
container_name: shinyproxy
ports:
- "8080:8080"
volumes:
- ./application.yml:/opt/shinyproxy/application.yml:ro
- /var/run/docker.sock:/var/run/docker.sock
- shinyproxy-logs:/opt/shinyproxy/log
networks:
- shinyproxy-net
restart: unless-stopped
networks:
shinyproxy-net:
name: shinyproxy-net
driver: bridge
volumes:
shinyproxy-logs:
# Create the network first (ShinyProxy spawns containers on this network)
docker network create shinyproxy-net
# Start ShinyProxy
docker compose up -d
# Check logs
docker compose logs -f shinyproxy
期待結果: ShinyProxyがポート8080で起動し、ログインページを表示し、設定済みアプリを一覧表示する。
失敗時: docker compose logs shinyproxyを確認する。アプリイメージがローカルで利用可能か確認する(docker images)。
ステップ2で示したauthentication: simpleとインラインユーザー。
proxy:
authentication: ldap
ldap:
url: ldap://ldap.example.com:389/dc=example,dc=com
manager-dn: cn=admin,dc=example,dc=com
manager-password: ldap_admin_password
user-search-base: ou=users
user-search-filter: (uid={0})
group-search-base: ou=groups
group-search-filter: (member={0})
proxy:
authentication: openid
openid:
auth-url: https://auth.example.com/realms/myrealm/protocol/openid-connect/auth
token-url: https://auth.example.com/realms/myrealm/protocol/openid-connect/token
jwks-url: https://auth.example.com/realms/myrealm/protocol/openid-connect/certs
client-id: shinyproxy
client-secret: your_client_secret
roles-claim: realm_access.roles
本番環境では、ShinyProxyの前にNginxを配置する:
map $http_upgrade $connection_upgrade {
default upgrade;
'' close;
}
server {
listen 443 ssl;
server_name shiny.example.com;
ssl_certificate /etc/letsencrypt/live/shiny.example.com/fullchain.pem;
ssl_certificate_key /etc/letsencrypt/live/shiny.example.com/privkey.pem;
location / {
proxy_pass http://shinyproxy:8080;
proxy_http_version 1.1;
proxy_set_header Upgrade $http_upgrade;
proxy_set_header Connection $connection_upgrade;
proxy_set_header Host $host;
proxy_set_header X-Real-IP $remote_addr;
proxy_set_header X-Forwarded-For $proxy_add_x_forwarded_for;
proxy_set_header X-Forwarded-Proto $scheme;
proxy_read_timeout 600s;
proxy_buffering off;
}
}
WebSocketサポートが重要 — ShinyProxyとShinyはWebSocketを多用する。
ShinyProxyはログファイルに利用イベントを記録する。構造化された追跡にはInfluxDBを設定する:
proxy:
usage-stats-url: http://influxdb:8086/write?db=shinyproxy
usage-stats-username: shinyproxy
usage-stats-password: stats_password
ComposeスタックにInfluxDBを追加する:
services:
influxdb:
image: influxdb:1.8
environment:
INFLUXDB_DB: shinyproxy
INFLUXDB_ADMIN_USER: admin
INFLUXDB_ADMIN_PASSWORD: admin_password
volumes:
- influxdata:/var/lib/influxdb
networks:
- shinyproxy-net
volumes:
influxdata:
specs:
- id: dashboard
container-image: myorg/dashboard:latest
container-memory-limit: 1g
container-cpu-limit: 1.0
max-instances: 5
container-env:
R_MAX_MEM_SIZE: 768m
# Check ShinyProxy health
curl -s http://localhost:8080/actuator/health
# Test login
curl -s -c cookies.txt -d "username=admin&password=admin_password" \
http://localhost:8080/login
# List apps via API
curl -s -b cookies.txt http://localhost:8080/api/proxyspec
期待結果: ヘルスエンドポイントがUPを返す。ログインが成功する。アプリが隔離されたコンテナで起動する。
dockerグループのユーザーとして実行するか、ソケットをマウントするcontainer-networkが一致する必要がある)docker psで確認しクリーンアップするcontainer-memory-limitを設定するdeploy-shiny-app -- shinyapps.io、Posit Connect、またはDockerへの単一アプリデプロイメントconfigure-reverse-proxy -- WebSocketプロキシを含むリバースプロキシパターンcreate-dockerfile -- アプリイメージ用の一般的なDockerfile作成create-r-dockerfile -- rockerイメージを使用するR固有のDockerfile