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name: install-putior description: > Instalar y configurar el paquete R putior para visualización de flujos de trabajo. Cubre la instalación desde CRAN y GitHub, dependencias opcionales (mcptools, ellmer, shiny, shinyAce, logger, plumber2) y verificación del pipeline completo de anotación a diagrama. Úsalo al configurar putior por primera vez, al preparar una máquina para tareas de visualización de flujos de trabajo, cuando una habilidad descendente requiere que putior esté instalado, o al restaurar un entorno después de una actualización de versión de R o un borrado de renv. locale: es source_locale: en source_commit: ecece0b7 fence_basis_commit: ecece0b7 translator: claude-opus-4-6 translation_date: 2026-03-16 license: MIT allowed-tools: Read Write Edit Bash Grep Glob metadata: author: Philipp Thoss version: "1.0" domain: workflow-visualization complexity: basic language: R tags: putior, install, workflow, mermaid, visualization, R

Install putior

Instalar el paquete R putior y sus dependencias opcionales para que el pipeline de anotación a diagrama esté listo para usar.

Cuándo Usar

• Al configurar putior por primera vez en un proyecto o entorno
• Al preparar una máquina para tareas de visualización de flujos de trabajo
• Cuando una habilidad descendente (analyze-codebase-workflow, generate-workflow-diagram) requiere que putior esté instalado
• Al restaurar un entorno después de una actualización de versión de R o un borrado de renv

Entradas

• Requerido: Acceso a una instalación de R (>= 4.1.0)
• Opcional: Si instalar desde CRAN (predeterminado) o versión de desarrollo de GitHub
• Opcional: Qué grupos de dependencias opcionales instalar: MCP (mcptools, ellmer), interactivo (shiny, shinyAce), registro (logger), ACP (plumber2)

Procedimiento

Paso 1: Verificar la Instalación de R

Confirma que R está disponible y cumple el requisito de versión mínima.

R.Version()$version.string
# Must be >= 4.1.0

# From WSL with Windows R
"/mnt/c/Program Files/R/R-4.5.2/bin/Rscript.exe" -e "cat(R.version.string)"

Esperado: Cadena de versión de R impresa, >= 4.1.0.

En caso de fallo: Instala o actualiza R. En Windows, descarga desde https://cran.r-project.org/bin/windows/base/. En Linux, usa sudo apt install r-base.

Paso 2: Instalar putior

Instala desde CRAN (estable) o GitHub (desarrollo).

# CRAN (recommended)
install.packages("putior")

# GitHub dev version (if latest features needed)
remotes::install_github("pjt222/putior")

Esperado: El paquete se instala sin errores. library(putior) carga silenciosamente.

En caso de fallo: Si la instalación de CRAN falla con "not available for this version of R", usa la versión de GitHub. Si GitHub falla, verifica que remotes esté instalado: install.packages("remotes").

Paso 3: Instalar las Dependencias Opcionales

Instala los paquetes opcionales según la funcionalidad requerida.

# MCP server integration (for AI assistant access)
remotes::install_github("posit-dev/mcptools")
install.packages("ellmer")

# Interactive sandbox
install.packages("shiny")
install.packages("shinyAce")

# Structured logging
install.packages("logger")

# ACP server (agent-to-agent communication)
install.packages("plumber2")

Esperado: Cada paquete se instala sin errores.

En caso de fallo: Para mcptools, asegúrate de que remotes esté instalado primero. Para errores de dependencias del sistema en Linux, instala las bibliotecas requeridas (p.ej., sudo apt install libcurl4-openssl-dev para la dependencia httr2).

Paso 4: Verificar la Instalación

Ejecuta el pipeline básico para confirmar que todo funciona.

library(putior)

# Check package version
packageVersion("putior")

# Verify core functions are available
stopifnot(
  is.function(put),
  is.function(put_auto),
  is.function(put_diagram),
  is.function(put_generate),
  is.function(put_merge),
  is.function(put_theme)
)

# Test basic pipeline with a temp file
tmp <- tempfile(fileext = ".R")
writeLines("# put id:'test', label:'Hello putior'", tmp)
cat(put_diagram(put(tmp)))

Esperado: Código de diagrama Mermaid impreso en la consola que contiene test y Hello putior.

En caso de fallo: Si put no se encuentra, el paquete no se instaló correctamente. Reinstala con install.packages("putior", dependencies = TRUE). Si el diagrama está vacío, verifica que el archivo temporal fue creado y que la sintaxis de anotación usa comillas simples dentro de comillas dobles.

Importante: Las paletas personalizadas no se pueden usar a través de MCP. El parámetro palette de put_diagram acepta un objeto R putior_theme creado por put_theme(). Debido a que MCP se comunica mediante JSON, los objetos R como putior_theme no pueden serializarse a través del límite MCP. Al llamar a put_diagram mediante MCP, usa el parámetro theme basado en cadenas (p. ej., theme = "viridis") en su lugar. Para paletas personalizadas, llama a put_theme() y put_diagram(palette = ...) directamente en una sesión de R.

Valores predeterminados clave: Todas las funciones de escaneo (put(), put_auto(), put_generate(), put_merge()) tienen recursive = TRUE como predeterminado, escaneando subdirectorios automáticamente. Este es un cambio disruptivo respecto a las versiones anteriores a la 0.2.0, donde el predeterminado era FALSE. Todas las funciones de escaneo también aceptan un parámetro exclude para el filtrado de archivos basado en expresiones regulares (p. ej., put("./src/", exclude = "test_")).

Si el paquete opcional shiny está instalado, prueba el sandbox interactivo:

putior::run_sandbox()

Esto lanza un editor basado en navegador donde puedes experimentar con la sintaxis de anotación PUT y ver los diagramas renderizados en tiempo real.

Validación

• library(putior) carga sin errores
• packageVersion("putior") devuelve una versión válida
• put() con un archivo que contiene una anotación PUT válida devuelve un data frame con una fila
• put_diagram() produce código Mermaid que comienza con flowchart
• Todas las dependencias opcionales solicitadas cargan sin errores

Errores Comunes

• Anidamiento de comillas incorrecto: Las anotaciones PUT usan comillas simples dentro de la anotación: id:'name', no id:"name" (que entra en conflicto con el delimitador de cadena de comentario en algunos contextos).
• Pandoc faltante para viñetas: Si planeas compilar las viñetas de putior localmente, asegúrate de que RSTUDIO_PANDOC esté configurado en .Renviron.
• Aislamiento de renv: Si el proyecto usa renv, debes instalar putior dentro de la biblioteca de renv. Ejecuta renv::install("putior") en lugar de install.packages("putior").
• Límites de tasa de GitHub: Instalar mcptools desde GitHub puede fallar sin un GITHUB_PAT. Configura uno via usethis::create_github_token().

Habilidades Relacionadas

• analyze-codebase-workflow — siguiente paso después de la instalación para examinar un codebase
• configure-putior-mcp — configurar el servidor MCP después de instalar las dependencias opcionales
• manage-renv-dependencies — gestionar putior dentro de un entorno renv
• configure-mcp-server — configuración general del servidor MCP