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bedtools-genomic-intervals

bedtools-genomic-intervals

Genomic interval ops on BED/BAM/GFF/VCF. Find overlaps, merge intervals, compute coverage, extract FASTA, find nearest features. Core for ChIP-seq peak annotation, region filtering, genome arithmetic. Use tabix for indexed single-region queries; use deeptools for normalized bigWig coverage.

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Jjaechang-hits / sciagent-skillsSource-available

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