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nested-TAD-detection

nested-TAD-detection

This skill detects hierarchical (nested) TAD structures from Hi-C contact maps (in .cool or mcool format) using OnTAD, starting from multi-resolution .mcool files. It extracts a user-specified chromosome and resolution, converts the data to a dense matrix, runs OnTAD, and organizes TAD calls and logs for downstream 3D genome analysis.

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Ddiegosouzapw / awesome-omni-skillNOASSERTION

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Licence: NOASSERTION
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