La interfaz está localizada; las descripciones y documentos de las Skills se traducen automáticamente con IA a su idioma. El código, los comandos, rutas y términos técnicos se mantienen en el original, y prevalece el documento del autor.
Explorar Skills
Desarrollo · SKILL.md

add-rcpp-integration

add-rcpp-integration

Add Rcpp or RcppArmadillo integration to an R package for high-performance C++ code. Covers setup, writing C++ functions, RcppExports generation, testing compiled code, and debugging. Use when an R function is too slow and profiling confirms a bottleneck, when you need to interface with existing C/C++ libraries, or when implementing algorithms (loops, recur…

Independent GitHub snapshot · Automated classification · Original documentation governs

Documentación de la Skill

GitHub

name: add-rcpp-integration locale: wenyan-ultra source_locale: en source_commit: 82c77053 fence_basis_commit: 82c77053 translator: "Julius Brussee homage — caveman" translation_date: "2026-04-19" description: > Add Rcpp or RcppArmadillo integration to an R package for high-performance C++ code. Covers setup, writing C++ functions, RcppExports generation, testing compiled code, and debugging. Use when an R function is too slow and profiling confirms a bottleneck, when you need to interface with existing C/C++ libraries, or when implementing algorithms (loops, recursion, linear algebra) that benefit from compiled code. license: MIT allowed-tools: Read Write Edit Bash Grep Glob metadata: author: Philipp Thoss version: "1.0" domain: r-packages complexity: advanced language: R tags: r, rcpp, cpp, performance, compiled-code

接 Rcpp

入 C++ 於 R 包以速關行。

用

  • R 函慢、剖證瓶→用
  • 接既有 C/C++ 庫→用
  • 算(環、遞)益於編→用
  • 增 RcppArmadillo 為線代→用

入

  • 必:既存 R 包
  • 必:欲代或補之 R 函
  • 可:欲接之外 C++ 庫
  • 可:用 RcppArmadillo 否(默純 Rcpp)

行

一:設 Rcpp 基

usethis::use_rcpp()

此:

  • 建 src/
  • 入 Rcpp 於 LinkingTo 與 Imports
  • 建 R/packagename-package.R 含 @useDynLib 與 @importFrom Rcpp sourceCpp
  • 更 .gitignore 避編檔

RcppArmadillo:

usethis::use_rcpp_armadillo()

得:src/ 已建,DESCRIPTION 含 Rcpp 於 LinkingTo 與 Imports,R/packagename-package.R 含 @useDynLib。

敗:usethis::use_rcpp() 敗→手建 src/、入 LinkingTo: Rcpp 與 Imports: Rcpp 於 DESCRIPTION,入 #' @useDynLib packagename, .registration = TRUE 與 #' @importFrom Rcpp sourceCpp 於包級文。

二:書 C++ 函

建 src/my_function.cpp:

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

//' Compute cumulative sum efficiently
//'
//' @param x A numeric vector
//' @return A numeric vector of cumulative sums
//' @export
// [[Rcpp::export]]
NumericVector cumsum_cpp(NumericVector x) {
  int n = x.size();
  NumericVector out(n);
  out[0] = x[0];
  for (int i = 1; i < n; i++) {
    out[i] = out[i - 1] + x[i];
  }
  return out;
}

RcppArmadillo:

#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

//' Matrix multiplication using Armadillo
//'
//' @param A A numeric matrix
//' @param B A numeric matrix
//' @return The matrix product A * B
//' @export
// [[Rcpp::export]]
arma::mat mat_mult(const arma::mat& A, const arma::mat& B) {
  return A * B;
}

得:C++ 源於 src/my_function.cpp,含有效 // [[Rcpp::export]] 與 //' 註。

敗:驗檔用 #include <Rcpp.h>(Armadillo 用 <RcppArmadillo.h>),出註於函簽前獨行,返型映 Rcpp 有效型。

三:生 RcppExports

Rcpp::compileAttributes()
devtools::document()

得:R/RcppExports.R 與 src/RcppExports.cpp 自生。

敗:察 C++ 語誤。確 // [[Rcpp::export]] 標於各出函上。

四:驗編

devtools::load_all()

得:包編、載而無誤。

敗:察編出。常症:缺系頭→裝開發庫;語誤→C++ 編訊指行;缺 Rcpp::depends 屬於 RcppArmadillo。

五:書測編

test_that("cumsum_cpp matches base R", {
  x <- c(1, 2, 3, 4, 5)
  expect_equal(cumsum_cpp(x), cumsum(x))
})

test_that("cumsum_cpp handles edge cases", {
  expect_equal(cumsum_cpp(numeric(0)), numeric(0))
  expect_equal(cumsum_cpp(c(NA_real_, 1)), c(NA_real_, NA_real_))
})

得:測過,證 C++ 函果同 R 等且妥處邊例(空向、NA)。

敗:NA 測敗→於 C++ 加 NumericVector::is_na() 之檢。空入測敗→於函首加零長守。

六:增清腳

建 src/Makevars:

PKG_CXXFLAGS = -O2

建 cleanup 於包根(為 CRAN):

#!/bin/sh
rm -f src/*.o src/*.so src/*.dll

可行:chmod +x cleanup

得:src/Makevars 設編旗,cleanup 去編對。皆於包根。

敗:驗 cleanup 有可行權(chmod +x cleanup),Makevars 用製表(非空)若加 Makefile 規。

七:更 .Rbuildignore

確編產妥處:

^src/.*\.o$
^src/.*\.so$
^src/.*\.dll$

得:.Rbuildignore 紋阻編對檔入包包,存源檔與 Makevars。

敗:行 devtools::check() 察 NOTE 關 src/ 中意外檔。調紋唯排 .o、.so、.dll。

驗

  • devtools::load_all() 編無警
  • 編函出正果
  • 邊例(NA、空、巨)測過
  • R CMD check 過無編警
  • RcppExports 已生且提
  • 性能改以基準證

忌

  • 忘 compileAttributes():改 C++ 後須重生 RcppExports
  • 整溢:大數用 double 非 int
  • 記理:Rcpp 自理 Rcpp 型;勿手 delete
  • NA 處:C++ 不知 R 之 NA。用 Rcpp::NumericVector::is_na() 檢
  • 跨台:避台專 C++ 特。測於 Windows、macOS、Linux
  • 缺 @useDynLib:包級文須含 @useDynLib packagename, .registration = TRUE

參

  • create-r-package — 增 Rcpp 前包設
  • write-testthat-tests — 測編函
  • setup-github-actions-ci — CI 須有 C++ 工
  • submit-to-cran — 編包需 CRAN 加察
Skills guardadas