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128 Skillssimultaneous

bio-crispr-screens-copy-number-correction

bio-crispr-screens-copy-number-correction

Corrects the gene-independent copy-number artifact in CRISPR-Cas9 screens (Aguirre 2016 / Munoz 2016 Cancer Discov) where amplified loci appear essential from DNA-damage burden of simultaneous cuts. Covers the gene-independent DNA-damage / G2-arrest mechanism, CRISPRcleanR (Iorio 2018) unsupervised pre-hoc correction, CERES (Meyers 2017) joint CN + gene-eff…

Daten und ForschungSKILL.mdVollständiges ZIP

bio-experimental-design-multiple-testing

bio-experimental-design-multiple-testing

Controls error rates across thousands of simultaneous tests in genomics discovery using false-discovery-rate methods (Benjamini-Hochberg 1995; Benjamini-Yekutieli 2001 for arbitrary dependence; Storey q-value with pi0 estimation; local FDR; independent filtering Bourgon 2010; covariate-weighted FDR via IHW Ignatiadis 2016), plus family-wise error control (B…

Design und KreativitätSKILL.mdVollständiges ZIP
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Sources and import coverage
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